La tradition veut que ce pesto soit né dans le port de Trapani, où les navires génois étaient amarrés. Grâce aux leçons de cuisine des Génois, notamment celles qui concernaient pesto, les habitants de Trapani ont élaboré une version entièrement sicilienne avec l'ajout d'ingrédients locaux, tels que des tomates fraîches, du pecorino sicilien et des amandes de première qualité. C'est ainsi qu'est née la version sicilienne du pesto classique.